サントリーでは、科学的根拠に基づいた安全性保証を担う部門として「安全性科学センター」を設置しています。
「分析科学グループ」、「微生物保証グループ」、「生物安全グループ」の分析機能を持ち、原材料、工程、商品、ご指摘品などの分析や安全性の評価を行っています。
各グループとも分析を行うだけでなく、自ら問題点を発見・発掘し、分析によってその原因をつきとめ対策を講じる、といった品質保証そのものを担っています。

また、2004年8月には中国に「中国（上海）品質保証センター」を設立。現地でのより迅速な分析体制を整備しています。

常に最新の技術を導入し、試験の精度向上と迅速化に努めるとともに、新たな食品の安全性に関する問題などに対応する技術の導入および開発も行っています。

また、国内外で発信される情報の収集や、行政・業界の動向についても調査し、食品の安全性に関わる問題を常に先取りしています。